En complément de MuséAl et du site antique, le Pôle archéologique départemental de l’Ardèche est également gestionnaire d’un dépôt de fouilles ; il dispose par ailleurs d’une habilitation de l’Etat pour conduire des missions d’archéologie préventive. Dans ce cadre, les archéologues départementaux sont amenés à intervenir partout sur le territoire ardéchois et de manière réactive pour un service de proximité. Ils réalisent des diagnostics et interviennent à la suite de découvertes fortuites et pour des expertises.
Les objets mis à jour lors des opérations archéologiques sont conservés dans un dépôt de fouilles départemental. Ce dépôt est géré conjointement avec le Service régional de l’archéologie (ministère de la culture) et accueille les chercheurs souhaitant étudier ces collections. Celles-ci viennent alimenter les expositions temporaires de MuséAl et celles d’autres établissements culturels par des prêts.